Unweit des Gerberviertels befindet sich der Komplex der Moschee und Universität Kairaouine, welches das bedeutendste Bauwerk von Fès el Bali ist. Gegründet wurde das Gotteshaus und interdisziplinäre Hochschule (jahrhundertlang ein wissenschaftlich-intellektuelles Zentrum) um 860. Es wurde im 12. Jh. erweitert und umgebaut. Der Komplex befindet sich auf 16 000qm Grundfläche mit 14 Monumentaltoren, 16 Schiffen mit je 21 Gewölbebögen, einem Sakralraum welcher 22 000 Gläubigen Platz bietet, und einem Wald von 270 Säulen.
Die Bibliothek und Handschriftensammlung der Kairaouine zählen zu den bedeutendsten der arabischen Welt.